同期，北京、成都、濟南、上海等地的整頓也在開始。以北京為例，在京東關停業務前，涉事的相關代售點已經被處罰，此后北京鐵路局又分批次進行了暗訪關停。4月25日更是一天內關掉8家。
　　
　　鐵道部對于代售點的嚴查使得代購網站業務一時間步入停滯。火車票的代購流程大致如下：用戶下單購買并提供身份證號，代購網站將購買人身份證號第一時間傳給有出票資質的合作代售點，代售點報號出票，并快遞寄送給購買人。
　　
　　這其中，“報號出票”是非常關鍵的一步。此前，鐵道部售票系統支持多種購票方式，既可以直接刷二代身份證，也可以報證件號碼，然后手工輸入號碼出票。但目前，多數代售點已經被掐斷報號出票功能，只有使用身份證原件才能出票。
　　
　　“這等于掐斷了代購的脖子。”一位被迫關停的一家大型火車票代購網站負責人稱。
　　
　　4月25日。鐵道部又發布了“關于進一步加強實名制售票工作的通知”，稱將繼續對所轄代售處進行暗訪檢查，被查出問題的代售處，將嚴格按《鐵路代售處管理辦法》的規定解除代售合同。
　　
　　未經鐵道部方面核實的消息顯示，目前北京涉事代售點達到40余家，全國已經近百家被關停或整頓。
　　
　　代購網站更是一時間風雨飄零。火車票網、趕火車網、支付寶、攜程、京東紛紛暫停代購業務。而作為最大、亦最早開始的火車票代購業務的網站鐵友網(原名久久票務網，后被攜程收購)，更是一度關閉了除上海以外的所有城市代購。
　　
　　代購利益鏈
　　
　　代購網站本身并不具備火車票銷售資質，其需尋找線下具有合法資質的代售點進行合作。具體合作模式是：到代售點幫旅客買票，然后快遞到家，從中收取一定數額的服務費。“就是賺一個快遞跑腿錢。”一位代購網站負責人解釋道。在過去三年，火車票代購領域出現了大大小小幾十家這樣的網站。另一位旅游網站負責人稱，車票預訂業務對網站其他業務的幫助非常大。火車票有規模巨大的消費群體和流量，可以極大地拉動酒店預訂、自助游、特色服務等高附加值的業務。而對于“找上門”來的代購網站的合作邀請，代售網點持歡迎態度。“這讓我們多了一個渠道。”北京某大型代售點負責人稱。
　　
　　鐵道部對于代購一直也并沒有太多的干涉。外界一度認為鐵路有可能像民航一樣逐漸放開票務分銷。
　　
　　目前尚沒有確切的消息說明是什么原因讓鐵道部在4月初開始整頓行動。一位接近鐵道部的人猜測稱，導火索很可能是京東的高調上線。
　　
　　該人士還稱，2011年初，鐵道部12306網站開始試運營，雖然12306預訂一度遭遇了春運時爆棚的意外情況，消費者方面亦反映體驗不佳，但鐵道部內部對其評價非常高。
　　
　　根據當年互聯網排名網站Alexa的排名，12306單日訪問量飆升至全球106位、直逼京東商城的第93位。“鐵道部內部覺得12306是一個電商網站，認為12306未來前景會非常好”。上述人士還稱。鐵道部官員此前曾公開表示，12306網站估值達100億。
　　
　　“網絡代購在票源中占據份額很小，即使攜程進入，也僅僅謹慎地停留在高鐵和動車預訂上。這一次，京東商城把火車票代購的事情給捅大了。”上述接近鐵道部的人士稱。
　　
　　他表示，京東商城的流量大，一線城市用戶數多，又有自己的快遞，一旦和擁有出票機的代售點合作，很有可能帶走12306網站的用戶。
　　
　　在鐵道部近日下發的相關文件中稱，代購網站擾亂鐵路售票秩序，而嚴打是“為了維護廣大旅客的權益”。
　　
　　不過，多位網站負責人對這一說法并不認同。他們認為，用戶購票都是通過支付寶這樣的第三方支付擔保交易，資金上首先是安全；火車票實名制以后，即使黃牛通過代購網站買到票，要退票也需要憑購票人身份證原件退，倒票已經很難進行。
　　
　　有資料顯示，成都鐵路局、廣州鐵路局旗下有分公司此前一直在從事相關代購業務。記者多次撥打鐵道部網站公示的辦公電話，但其電話一直處于無人接聽狀態。
　　
　　不可忽略的一個事實是，鐵路票務分銷放開的呼聲越來越大。12306在去年春運時候一度無法承受壓力，出現諸多問題和投訴。兩會期間亦有委員建議，鐵道部應該有條件放開票務分銷，讓更多商業公司參與其中。
　　
　　此前，已有很多相關洽談在進行。有消息人士透露，從兩年前開始，就有很多找上門合作的，其中包括了中移動、中電信、中聯通、中郵政、攜程等。
　　
　　不過，鐵道部方面對此態度依舊不明朗。鐵道部運輸局局長吳強不久前表態稱，鐵道部目前沒有考慮將購票資質放開到商業網站。而此次鐵道部規定不能線下與線上合作，也把原有道路徹底堵死。“鐵道部的這則公告，將讓火車票網絡分銷的利益鏈條發生改變。”某火車票網購公司的CEO說，原本在火車票代購的利益鏈條中，5元手續費部分上交給鐵路局(火車站)，以快遞費形式存在的代購費由代售點和代購網站進行分成。
　　
　　業內普遍認為未來一種可能的情況是在有條件的情況下放開，即代購網站和12306或者地方路局合作。鐵道部劃定一塊區域給商業性網站，并參與最終的分成。
　　
　　有消息稱攜程網還在和鐵道部方面進行相關溝通。攜程一位高管稱目前洽談還沒有相關進展。